É bom pensar da seguinte maneira:

1. É necessário realmente ter o backend separado da sua interface?
2. Existem sistemas que não precisam de ter uma api separada, talvez é melhor ter um projeto de negócio que se conecta direto com a interface do usuário;
3. Mas existem projetos que precisam de uma parte separada, como uma API;
4. Você pode pensar de várias maneiras, mas pense na principal: quantas interfaces do usuário você vai ter em seu sistema? Web interface? Desktop interface? Mobile interface? Car interface? IO interface? Se você perceber que terá mais de uma interface, então é bom ter uma API.

Como separar a sua API?

É necessário pensar em:

1. Projeto de biblioteca / Library project
2. Separa a biblioteca em Repository / Repositório e Service / Serviço.
3. Cada repositório e serviço precisa ter uma interface
4. Crie depois um projeto do tipo API que vai se conectar à biblioteca / library
5. A API terá controladores / Controllers para receber a requisição do user interface
6. Os controladores vão chamar a camada da biblioteca chamada serviço.
7. Não esqueça de usar a mais moderna conexão para criar conexões sem usar o comando new Class( )
8. Não esqueça de ter uma interface que verifique token de acesso
9. Não esqueça de ter uma interface para interceptar o login
10. Não esqueça de uma parte de criptografia para deixar os dados mais seguros usando a mais moderna criptografia.

Tudo isso eu ensino no curso Web API do ecode10.academy. Espero ter ajudado.